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RNA-seq

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RNA-seq

详细介绍

新一代高通量测序技术和高性能的生物信息分析实现了表达谱分析的数字化、高效性,能够全面、快速地定量检测物种特定组织或发育时期的基因表达种类和丰度信息。

 

技术原理

数字基因表达谱(DGE)测序指直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,研究基因的表达差异情况,已被广泛应用于基础科学研究、疾病机理、生物标记和药物研发等领域。

技术流程

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分析流程

表达谱测序及信息分析

技术优势

1.  数字化信号:直接测定每个基因的特异表达标签序列,通过计数表达标签序列的数目来确定该基因的表达量,大大提高了定量分析的准确度;

2.  可重复性高:不同批次的表达谱度量准确,能够更准确的进行表达差异分析;

3.  高灵敏度:对于表达存在差异的基因能够灵敏的检测其表达差异,能够检测出低丰度的表达基因;

4.  高通量:一次测序可得到800万以上的序列;

5.  高准确性:使用RPKM方法计算基因表达量,消除基因长度和测序量差异对计算基因表达的影响确保基因表达量计算的高准确性

 

样品要求

1.  样品类型:总RNA;

2.  样品浓度:≥250 ng/ul;

3.  样品总量:>20ug;(不包括样品检测损耗);

4.  样品纯度:OD260/280为1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260nm处有正常峰值;

5.  RNA完整性: 电泳检测28S/18S≥1.5。(距送样日近期的电泳结果)。

 

测序方案

1.  测序平台:BGI 500;

2.  测序类型:单端测序,SE50;

3.  测序数据量:大于10M tag。

 

结果展示

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差异基因韦恩图

 基因表达调控

RNA-seq


 


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